Для удовлетворения питьевых и хозяйственно-бытовых потребностей жителей Ярославской области в основном используют поверхностные воды. Подземные воды занимают около 16% общего объема потребления — в основном в сельских поселениях и поселках городского типа.
Низкое качество воды поверхностных источников вызвано сбросом отходов промышленных и коммунальных предприятий в реки бассейна Волги. Большинство стоков либо не очищены, либо очищены недостаточно. Основные загрязнители поверхностных вод — нефтепродукты, медь, железо и органические вещества.
В подземных водах зафиксировано повышенное содержание железа, марганца, кремния и бора.